目前，该病的发病率成为性病中较高之一。在西方国家中，该病超过淋病，成为主要影响他们健康的性病。60年代以来非特异性尿道炎发病率骤增，该病居性传播疾患发病率的首位。非淋菌性尿道炎也称为非特异性尿道炎和非特异性生殖道感染。再者，由于非淋菌性尿道炎属于性接触传染，也称性传播疾病。
该病多发生于青年性旺盛期，25岁以下占60%。据报道，80年代美国每年新发生的病例达300－1000万人。每年用于治疗本病医疗费达20亿美元，可见本病传播范围甚广。而在我国80年代初，发病率并不高，至从90年代后，一直到现在，发病率逐渐增加，该病也成为我国主要性病。
一般非淋菌性尿道炎，会与淋病交叉感染，它们同时存在的原因。非淋菌性尿道炎虽然症状比淋病轻，但危害并不会比淋病轻。由于发病缓慢因素，在感染病原体1～3周以后才会发病；患者觉得症状较轻，往往不及时治疗。然而使得很多患者失去了治疗的佳时期，患者想治疗的时候非常困难。该病尤其在女性比较显着，由于症状极其轻微，而女性感染者往往不予治疗，这样导致了该病传播给其他人机会增加。
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