尿道炎的诊断除根据病史及体征外，需将尿道分泌物行涂片染色检查或细菌培养，以明确致病菌，男病人若无尿道分泌物，应行尿三杯试验。急性期尿道内忌用器械检查，慢性尿道炎还需检查前列腺、精囊、附皋等，有时需行尿道膀胧镜检查以便明确发病的原因。
有时需行金属尿道探条试探尿道内有无狭窄，必要时行尿道造影。对于男性患者除外淋病外，还应检查有无衣原体或支原体感染。与淋病性尿道炎区别在于淋病性尿道炎是一种特异性感染的性病，尿道有脓性分泌物，脓液涂片染色检查可见在分叶核粒细胞内有革兰阴性双球菌；与滴虫性尿道炎区别在于女性容易在阴道内找到滴虫，而在男性不易找到滴虫，常需在包皮下、尿道口分泌物、前列腺液以及尿液中检查有无滴虫。
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