生殖器疱疹一般分为原发性和复发性两种。
原发性生殖器疱疹
一般潜伏期2~7天，比较短。
皮损形态演变：患部先有烧灼感，由于人体对它还没有任何免疫力，初次发生疱疹会比较较大，溃疡处疼痛明显。原发皮损是由一个或多个瘙痒的红丘疹，迅速变成水疱。3~5天后，会变成糜烂或溃疡、结痂，有疼痛。发病时及发病前夕可有全身症状，包括发热、全身不适、颈项强直、头痛，在骶椎2~4节段出现感觉异常。
男性好发部位在龟头、冠状沟、阴囊、尿道口或阴茎体；女性是位于会阴部、肛门周围、大腿或臀部，约有90%同时侵犯子宫颈。通常女性原发疱疹仅仅累及子宫颈，故而易被忽略。感染的疱疹病毒时，宫颈外观可以正常或潮红，或伴有多个散在的溃疡。而该病毒对阴道的损害不多见。肛门的直接损害可无自觉症状或伴有痒感、排脓以及里急后重感。一般所有原发生殖器疱疹均可伴有淋巴结肿大、压痛、经1~2个月才缓慢消退。
复发性生殖器疱疹
在原发性生殖疱疹病毒感染痊愈后，一年之内可能还会复发4~6次，慢慢次数会减少。被感染者将近有60%的患者复发。而发热、月经来潮、性交、情绪激动、消化不良或气侯变化均都是诱发复发的因素。复发一般都在原处，但水疱数目、持续时间和自觉症状均比原发者轻，淋巴结不肿大。生殖器感染II型疱疹病毒者，复发更多。
有资料介绍，I型疱疹病毒感染只有14%复发，而II型疱疹病毒感染复发率则高达60%。原发或复发生生殖器疱疹可伴有排尿困难、急性尿潴留、疱疹性瘭疽、脑炎、子宫内膜炎。
生殖器疱疹，由于病情反复发作，又无特效药物控制，加之难以忍受连药物亦无法制止的烧灼样局部疼痛，常常使患者产生沉重的心理负担。他们害怕疼痛、害怕传染给与其有性关系的人、害怕癌变。肉体的痛苦加上精神的负担，往往使患者自尊心受挫，使之不愿与异性交往，从而导致性功能障碍，影响夫妻感情及家庭的和睦，久而久之甚至发生抑郁症。
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