发生隐睾丸的原因主要有两个：一个是机械的因素，睾丸下降时要依靠精索的引力，假如精索太短，或粘连，或没有，则使睾丸不能下降。另一个原因是母体中的促性腺激素不足，或者虽有激素但睾丸发育不好，因此睾丸只能呆在原位，或者下降有限而不能到达阴囊。
隐睾症对人体有有以下几方面危害：
⑴精神和心理影响。比较大的男孩发现阴囊中没有睾丸会产生一种自卑心理状态，时间长了，对孩子的身心健康会产生严重的影响。由于隐睾症有以上这些害处，发现孩子阴囊里没有睾丸要及时找医生诊治。
⑵睾丸癌变。患隐睾症的人容易发生睾丸恶性肿瘤，这是泌尿科医师一致的看法。当然正常位置的睾丸也可长癌，但是隐睾症发生癌变比正常位置要多30－50倍。主要原因是局部温度高、内分泌失调及睾丸发育不全。隐睾癌变多发生在青春期以后，甚至有人发现，青春期以后已经进行睾丸固定手术的病人仍然容易发生癌变，因此，主张尽量早做手术。
⑶睾丸位于腹股沟部，比较表浅，容易受伤。有时人体受到意外撞击或震荡时，还可产生睾丸扭转，这时会产生剧烈疼痛，甚至可以导致睾丸坏死。
⑷影响睾丸生精功能，因为睾丸位于腹股沟或腹膜后，那里的温度比阴囊高1.5－2.5°Ｃ，因此，可导致睾丸曲细精管萎缩退化，阻碍精子的产生。如果双侧隐睾得不到治疗，睾丸功能严重障碍，不能产生精子，就会造成不育。单侧隐睾则可使生育能力降低。
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